《条例(草案)》规定，在地下饮用水水源保护区或者准保护区内堆放和贮存易溶、含有毒素污染物的废弃物；在地下饮用水水源保护区内堆放垃圾、粪便及其他可能污染地下饮用水水源的固体废物；在地下饮用水水源保护区内新建贮存液体化学原料、油类或者其他含有污染物质的地下工程设施的，相关主管部门可处以1万元以上，10万元以下罚款。
对有关排污单位违反条例规定的，并且不执行更加严格的水污染防治措施，造成水环境污染的，由相关主管部门处以1万元以上，10万元以下的罚款，情节严重的，可由主管部门责令停产、停业。
对违反规定，向雨水收集口、雨水管道排放或者倾倒污水、污物和垃圾等废弃物的，由城市管理综合执法部门责令停止违法行为，对个人处以1000元以上，1万元以下的罚款；对单位处1万元以上，10万元以下的罚款。
此外，《条例(草案)》提出，对举报属实的举报人给予奖励，对侵权诉讼案件受害人给予法律支持，再生水用量纳入重点行业用水指标。