非２１１、９８５歧视不公平、不科学
专家测算，“２１１工程”院校只占全国高校总数６％，毕业生人数不到全国高校毕业生１０％，２０１３年全国高校毕业生高达６９９万。
据分析，虽然２１１、９８５高校的生源质量、师资水平、教学水准确实整体上要优于一般大学，但是不能否认大学生存在个体差异，一般大学也有优秀生。
罗和安认为，社会公平首先应是机会公平。在就业领域，名牌大学不应成为求职者的准入限制，目前还没有充分证据表明非２１１高校毕业生不能胜任哪些工作。所以用“院校门槛”来区别对待２１１和非２１１高校毕业生过于简单粗暴，实际上剥夺了绝大多数毕业生参与公平竞争的机会。
北京大学社会学教授夏学銮指出，我国农村大学生很多集中于非“２１１工程”高校，就业时学历不过硬，又受户籍等限制，这样一来他们的上升通道受阻。这种现象如果代际传递，后果不堪设想。
夏学銮、罗和安等表示，用人单位设置２１１、９８５“院校门槛”，不利于社会选拔多样化人才，也不利于社会阶层流动，对实现高等教育结果公平，会产生十分消极的影响。